慢性咽炎最先的反应应该是咽部的局部抵抗力下降，抵抗力下降后就会出现种种难受的症状。遇气候冷、热、干、湿变化时，粘膜的加温、加湿调节作用减弱，纤毛活动和吞噬功能不足，细菌和病毒容易在局部停留繁殖，成为慢性感染病灶，因而很容易诱发感冒，引起咽炎急性发作，而且反复感染，很难愈痊。而咽部的感染炎症波及身体其它系统时，可能并发慢性喉炎、慢性气管及支气管炎、肾炎及其它病患。长期炎性分泌物被咽入胃中，可能引起消化不良、食管炎、胃炎、肠炎等。
急性咽炎急性咽炎发作时，如果咽痛剧烈，不仅影响吞咽，还会造成体内营养、代谢失调。如果感染向上蔓延，波及耳、鼻，可导致急性鼻炎、鼻窦炎，急性中耳炎;向下发展，可能侵犯喉、气管等下呼吸道，引起急性喉炎、气管炎、支气管炎及肺炎;如有细菌感染时，血液白细胞数会升高。
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